H-D-Val-Leu-Arg-AFC;D - Valine - Leucine - Arginine
1. 基本信息
- ️英文名称:H-D-Val-Leu-Arg-AFC,其中 H 表示氨基端游离(N - terminal free),AFC 是 7 - amino - 4 - trifluoromethylcoumarin(7 - 氨基 - 4 - 三氟甲基香豆素)的缩写,完整名称为 N - terminal free - D - Valine - Leucine - Arginine - 7 - amino - 4 - trifluoromethylcoumarin
- ️中文名称:N 端游离 - D - 缬氨酰 - 亮氨酰 - 精氨酰 - 7 - 氨基 - 4 - 三氟甲基香豆素
- ️氨基酸序列:D - Valine - Leucine - Arginine
- ️单字母序列:DVLRAFC(AFC 作为非氨基酸标记部分一并列出)
- ️三字母序列:D - Val - Leu - Arg - AFC
- ️分子量:约 643.73 Da(计算时包含 AFC 部分)
- ️分子式:C₂₉H₄₀F₃N₇O₆
- ️等电点:约 10.5,由于含有精氨酸,整体呈碱性
- ️CAS 号:目前暂未广泛报道该特定化合物的 CAS 号
- 供应商:上海楚肽生物科技有限公司
2. 结构信息
H-D-Val-Leu-Arg-AFC 由三个氨基酸(D - 缬氨酸、亮氨酸、精氨酸)和一个荧光标记基团 7 - 氨基 - 4 - 三氟甲基香豆素(AFC)组成。从一级结构看,D - 缬氨酸的引入使该肽链具有不同于 L - 氨基酸的立体化学性质,可能影响其与靶点的结合特异性 。亮氨酸为非极性氨基酸,增加了肽链的疏水性,精氨酸带有正电荷的胍基侧链,赋予整个分子一定的碱性和极性 。AFC 基团通过肽键与精氨酸的羧基端相连,其具有荧光特性,可用于后续检测 。
在空间结构上,该化合物中的氨基酸部分可能会形成一定的二级结构,如无规卷曲,而 AFC 基团则暴露在外部 。AFC 的三氟甲基和香豆素结构赋予其特定的荧光光谱特性,在合适的激发光下,能够发射出可检测的荧光信号 。
3. 作用机理及研究进展
H-D-Val-Leu-Arg-AFC 常作为底物用于检测特定蛋白酶的活性 。其作用机理基于蛋白酶对底物的特异性切割。当存在能够识别并切割 D - Val - Leu - Arg 序列的蛋白酶时,该底物会被水解,释放出游离的 AFC 。由于游离 AFC 的荧光强度相较于与肽段相连时会显著增强,通过检测荧光强度的变化,即可定量分析蛋白酶的活性 。
在研究进展方面,此类荧光底物被广泛应用于蛋白酶的筛选、活性测定以及新型蛋白酶抑制剂的研发 。例如,在研究新型抗肿瘤药物时,通过检测肿瘤相关蛋白酶对 H-D-Val-Leu-Arg-AFC 的切割活性,评估药物对这些蛋白酶的抑制效果 。此外,在基础生物学研究中,利用该底物可以探究不同生理病理条件下蛋白酶活性的变化规律 。
4. 溶解保存
- ️溶解:H-D-Val-Leu-Arg-AFC 在有机溶剂如二甲基亚砜(DMSO)和 N, N - 二甲基甲酰胺(DMF)中具有较好的溶解性 。在配制溶液时,可先将其溶解于适量 DMSO 中,配制成高浓度母液,然后再用缓冲液(如 PBS 缓冲液,pH 7.4)稀释至所需浓度 。但需注意 DMSO 的最终使用浓度,在细胞实验中一般不超过 1%,以避免对细胞产生毒性 。该底物在水中的溶解性较差 。
- ️保存:干粉状态下,应将 H-D-Val-Leu-Arg-AFC 保存在 -20℃或更低温度环境中,以防止其降解 。溶解后的溶液,若短期使用(1 - 2 周内),可放置在 4℃保存;若长期保存,则需分装后置于 -20℃或 -80℃,且要避免反复冻融,因为反复冻融可能会影响其稳定性和荧光特性 。
5. 相关多肽
- ️H - Leu - Val - Arg - AFC:与 H-D-Val-Leu-Arg-AFC 结构类似,只是将 D - 缬氨酸替换为 L - 缬氨酸 。由于氨基酸构型的差异,其对不同蛋白酶的敏感性和切割效率可能不同,可作为对比底物用于研究蛋白酶对底物立体化学结构的选择性 。
- ️H - Ala - Ala - Arg - AFC:改变了氨基酸组成,用于检测对不同氨基酸序列具有特异性的蛋白酶 。通过与 H-D-Val-Leu-Arg-AFC 对比,可进一步明确特定蛋白酶的底物识别特征 。
6. 相关文献
[1] Barrett A J, McDonald J K. Handbook of Proteolytic Enzymes[M]. Academic Press, 1991.
[2] Bond J S, Butler P E. Proteolytic enzymes and their inhibitors in biological control[J]. Biochemical Society Transactions, 1987, 15(2): 305 - 312.
[3] Turk D, Stoka V, Turk V. Viral and cellular cysteine proteases[J]. Biochemical Journal, 2000, 347(1): 17 - 34.
[4] Polgar L. Enzyme Kinetics: Catalysis and Control[M]. Springer Science & Business Media, 2013.
[5] Shaw E. Enzyme Inhibitors: From Structure to Function[M]. CRC Press, 2013.
产品信息来源:楚肽生物
所有产品仅用作实验室科学研究,不为任何个人用途提供产品和服务。