同源性分析用氨基酸序列还是核苷酸序列?

2025-04-25ASPCMS社区 - fjmyhfvclm

濮阳惜珍的回答:


都有啊。你想做蛋白质氨基酸序列的同源分析当然就用氨基酸序列了,做某段非蛋白编码序列的分析那肯定是用核苷酸序列啊。进化树我没正式地做过,这里就不多说了,我以前玩票的时候用的是aa序列。

我呆的组做同源性分析(印象里都御晌凳是针对编码蛋白质的基因)有时是cdna序列,有时是aa序列,貌似用aa序列为多。做rnai时测序的转殖比对时一般就直接用测序的核苷酸序列(我们rnai的转殖一般是针对外显子设计的片段,sourcebioscience的线虫genomic library)。

一般来说,比较同源蛋白,用cdna和蛋白序列都可以。只不过蛋白更能看出保守区域,核酸的话,可能突变比较多没有,而且只有四种,没有二十种的氨基酸靠谱。如果,做小的基因组的比较,比如病毒序列,一般用全基因组,即核酸进行进化分析。

其实最重要的是你的物种直接的亲缘关係远近及对模型的了镇旅解,选择合适的方法。具体看杨子恆和其他大牛的书。树好画,理论解释比较难。

距离较远的序列比较用氨基酸序列更合适,进化距离很近的序列之间比较用核酸更合适。 亲缘关係较近的序列比较,如果用aa序列,很多同义突变的资讯都会漏掉;而亲缘较远的序列之间做align,重要的是功能谨誉保守的domain要对齐,这个时候用aa序列就比dna序列方便一点。 我个人来说,如果可以用dna align好就儘量用dna,这个时候要再translate到aa也方便。

有的序列可能用dna 不好align我才会用aa序列align。有了alignment再做树就简单了。就我个人经验,相同的序列dna树要可靠一点,因为aa树受自然选择影响更大(也可能是和我研究的序列相似性较高有关)。

彤蛋卉的回答:


所谓微生物同源分析,就是在一定的条件下,微生物菌株的进化关係的远近,随着技术的发展,人类的对于研究进化关係的远近的技术也发生着变化,形态学、生化方法、血隐改庆清学分析、条带分型、单基因分灶握型、多基因分型、基因组分型等等,技术本身的解像度也有高低之分。 pfge是一种条带分型方法,相比生化、形态学解像度比较高,与血清学或者多基因分型相比,解像度相当(有时前者高,有时后者高),基因组分型的解像度最高。 mrsa常用的分型包括spa分型、pfge分型、mlst分型以及全基因组分型,根据实验目的和预算来选择,spa和mlst可以用pcr的方法,最多送一代测序,pfge和全基因歼枯组都需要特定的装置仪器,一般外包做,如果预算还可以的话建议全基因组分型解决问题。

轻盈且温顺的小爱侣的回答:


直向同源基因(orthologous gene)又译为「垂直同源基因」、「正同源基因」 或「定向进化同源基因」、「直系同源基因」,是指从同一祖先垂直进化而来的基因。或返衡漏者说,乙个祖先拦明物种分化产生两种新物种,那么这两种新物种共同具有的由这个祖先物种继承下来的基因就称为直向同源基因。直向同源基因通常是编码生命必需的酶、辅酶或关键性的调控蛋白的基因,具有功能保守,进化缓慢,变化速度可覆盖整个进化历史,且序列变化速度与进化距离相当等特徵。

大多数直向同源基因功能相同或相近,调控途径也相似, 因此在基因组序列的注释漏烂中,是最可靠的选择,例如人α一珠蛋白基因与小鼠α一珠蛋白基因。<>

️基于核酸序列和氨基酸序列的进化分析有何差异

热心网友的回答:


相似性和同源性:相似性(similarity)和同源性( homology)是两个完全不同的概念。同源序列是指从某一共同祖先经过趋异进化而形成的不同序列。

相似性是指序列比对过程中检测序列和目标序列之间相同硷基或氨基酸残基序列所佔比例的大小。当两条序列同源时,它们的氨基酸或核苷酸序列通常有显着的一致性(identity).如果两条序列有乙个共同的进化祖先,那么它们是同源的。

这里不存在同源性(homology)的程度问题,两条序列要么是同源的要么是不同源的。

️氨基酸的序列多样性

单献裴秀妮的回答:


考点: 蛋白质分子结构多样性的原因 专题: 分析:

蛋白质多样性的直接原因是组成蛋白质的氨基酸的种类、数目、排列顺序和空间结构不同. a、构成蛋白质分子的氨基酸种类不同是蛋白质多样性的原因之一,a错误;b、构成蛋白质分子的氨基酸的排列顺序不同是蛋白质多样性的原因之一,b错误;c、蛋白质分子的空间结构同是蛋白质多样性的原因之一,c错误;d、连线氨基酸之间悔顷的碧虚陆化学键相同,都是誉大肽键,d正确.故选:d. 点评: 对于蛋白质多样性的原因的理解、识记是本题考查的重点.

️已知氨基酸序列如何确定mrna硷基序列

的回答:


答案a乙个氨基酸可以对应乙个或多个密码子,而密码子是mrna上特定的硷基序列,按照氨基酸的顺序可以确定mrna硷基序列。

️同源蛋白质氨基酸序列的这种相似性称为

奈子的回答:


同源蛋白质的氨基酸。

序列具有明显的相似性,这种相似性称为序列同源性。具有序列同源性的蛋白质称为同迟芹源蛋白质,同源亩纯蛋白共有的相似序列称为共义序列。

一)同源蛋白质的物种差异与生物进化。

同源蛋白质、细胞色迅旦咐素c、系统树。

二)同源蛋白质具有共同的进化起源。

氧合血红素蛋白质、丝氨酸蛋白酶类。

️基因是核苷酸数列还是性状

网友的回答:


基因是遗传的物质基础,是dna或rna分子上具有遗传资讯的特定核苷酸序列。

因此,基因不是指某乙个硷基对,或者某乙个硷基,而是指在dna上一段具有遗传资讯的核苷酸序列。特意强调的是具有遗传资讯者几个字,因为一条dna上不是所有的基因都具有遗传资讯,一条dna上可能只有若干的基因会具有遗传资讯。

答:因为dna上含有若干个基因,而每乙个基因通过翻译为rna,在通过rna的转录,形成具有与该基因决定具备相关功能的蛋白质。因此,只能说是基因来指导蛋白质合成,而不能说成是dna。

最后,aa aa aa是神马,他们难道也是硷基对?

答,这是等位基因,不是硷基对。即可以说a或者a这两个等位基因,每乙个是由若干的硷基对构成的。

不知道我表述清楚没有,如果您还有需要解释的请追问。

️基因文库核苷酸序列

学碧吕语风的回答:


a、基因的核苷酸序列可作为从基因文库中获取目的基因的根闹判蔽据;

b、基因的功能可作为从基因文库中获取目的基因的根据;

c、基因的转录产物mrna可作为从基因文库中获取目的基因的根据;

d、a、b和c选项均可作液州为从基因文冲李库中获取目的基因的根据.故选:d.

️氨基酸酸序列对比结果可用来研究什么?核苷酸序列对比结果又可用来研究什么?求大神解惑!

网友的回答:


由于密码子的简併性,核苷酸的变异不一定导致氨基酸的变异,所以氨基酸酸序列对比是相对于蛋白水平的,氨基酸的变异有可能导致蛋白质三维机构摺叠的不同,最终影响其功能。

核苷酸的变异现在一般用来做标记,或者是是作为某上游关键结合因子变异导致其结合蛋白无法结合上去。

说白了乙个是蛋白水平,乙个是基因水平。

️什么叫核苷酸序列

0o壹次心的回答:


核苷酸序列就是指dna或rna中硷基的排列顺序。

这意味着dna中a,t,g,c的排列循序,或者mrna中a,u,g,c的排列循序,也包括rrna,trna中硷基的排列顺序。

环核苷酸不存在核苷酸序列。

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